二妙丸對下列疾病有顯著療效:
皮膚科:濕疹、腳氣、陰囊濕疹、生殖器皰疹、帶狀皰疹、手癬、疥瘡、膿皰瘡、足癬、下肢急慢性濕疹、皮炎、肛門瘙癢癥、老年性瘙癢癥、酒渣鼻。
婦科:白帶異常(各種陰道炎引起)、急慢性尿路感染、月經不調、盆腔炎。
內科:腹瀉、痢疾、腸炎、黃疸、肝炎、胃炎、胃潰瘍(濕熱型)、失眠多夢(濕熱型)。
外科:足膝紅腫熱痛、類風濕性關節炎(濕熱證)、濕熱型下肢靜脈曲張、下肢潰瘍、糖尿病足、下肢丹毒、坐骨神經痛(濕熱證)、濕熱腰痛。
泌尿學:尿路感染
口腔醫學:口臭、口腔潰瘍、牙齦炎、牙周炎。
耳鼻喉科:慢性咽炎、慢性鼻竇炎、慢性上頜竇炎等。
男科:陽痿(濕熱下註)、睪丸炎或睪丸炎
濕熱往往表現為壹種體質，很難在短時間內消除，所以往往需要長期用藥。大部分燥濕清熱的藥藥性都很強，用藥要註意。二妙丸配方簡單，幾乎無毒副作用，長期服用非常安全。所以是祛濕清熱的首選。