目前臍帶間充質幹細胞可以治療的疾病超過140種。作為種子細胞，可用於修復/替代受損或患病的組織和器官，並可用於治療心腦血管疾病，如冠心病和心力衰竭。神經系統疾病:脊髓損傷、老年癡呆癥、帕金森病、腦癱等。骨組織疾病:骨質疏松、軟骨損傷、肌腱損傷等。自身免疫性疾病:系統性紅斑狼瘡、類風濕性關節炎、硬化癥等。以及肝硬化、缺血性血管疾病等疾病。
目前幹細胞研究中已經完成了壹系列安全性實驗，包括毒性試驗、遺傳試驗、局部刺激試驗、發熱試驗和免疫毒性試驗。結果表明，通過靜脈輸註進行幹細胞治療是安全無毒的。經過多次傳代，成體幹細胞沒有突變，即沒有腫瘤的可能。大量臨床資料也表明，幹細胞治療過程中除少數患者出現短期輕微發熱頭痛外，並無其他明顯副作用或不良反應。
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