除惡性淋巴腫瘤外,只要沒有其他禁忌癥,大多數原發性縱隔腫瘤都應手術治療。良性腫瘤或囊腫即使無癥狀,也會逐漸長大,壓迫鄰近器官,甚至惡性或繼發感染,所以手術是合適的。
如果惡性縱隔腫瘤已侵犯鄰近器官,不能切除或有遠處轉移,則禁忌手術,可根據病理性質給予放療或化療。