1.方法1:瘺管切開術
這是壹種切開所有瘺管並通過肉芽組織生長來愈合傷口的方法。適用於低位肛瘺，因為瘺口在外括約肌深部以下。刀開了以後，只是損傷了外括約肌的皮下和淺表部分。這次手術後，仍能保持正常的自主排便。
2.方法二:掛線療法
是利用橡皮筋或腐蝕性藥線的機械壓迫，緩慢切開肛瘺的方法。適用於距肛門3-5 cm以內的內外口低或高的單純性肛瘺，或作為復雜肛瘺切開切除的輔助治療。
3.方法三:肛瘺切除術
切開瘺口，將瘺壁全部切至健康組織，創面不縫合；如果傷口較大，可部分縫合，部分切開，用油紗布填塞，使傷口從底部向外生長愈合。這種方法非常簡單，適用於輕度肛瘺患者。
需要註意的事項
患肛瘺後，生活中不要吃刺激性食物，多喝水，不要抽煙喝酒，每天保持正常排便。即使過程很痛苦，也要積極配合醫生治療，不要亂吃藥治病。