在選擇藥物時，應優先選擇強效藥物。目前市場上常用的藥物主要有止瀉藥、抗生素、消炎藥、腸道愈合劑等。
其中最常用的藥物是止瀉藥，能有效減少犢牛的排泄次數，防止犢牛嘔吐。常用止瀉藥如三七、黃連素等可用於治療犢牛，預防感冒和過敏癥狀。但這類藥物要慎用，因為會對腸道造成壹定的傷害。
當犢牛腹瀉超過壹周或出現口腔潰瘍、砂便、黏膜色素沈著、貧血等癥狀時，可以使用壹些消炎藥，通常可以有效治療腸道炎癥，預防細菌和病毒感染，如青黛片、復方磺胺甲惡唑等。
抗生素用於治療微生物感染，可以殺死細菌和其他微生物，如泰克林和氨芐青黴素。
此外，tava硫酸鹽、beva馬來酸鹽等腸道愈合劑也能加速犢牛的腸道恢復。
總之，在處理犢牛腹瀉的過程中，要根據犢牛的具體情況來選擇藥物，並註意控制藥物的劑量和次數。同時也要密切註意犢牛的飲食和環境衛生，及時清除汙物，保持室內通風，增強犢牛的健康免疫力。