藥物治療，如果患者在C13或C14後，被證實並發幽門螺桿菌感染，通常建議患者接受基於質子泵抑制劑、鉍和兩種抗生素的Hp根除治療。經過根除治療後，患者的慢性胃炎癥狀往往會明顯改善。在患者維持的這個階段，常用的藥物都是根據患者的癥狀。如出現嚴重酸反應癥狀，會給予H2受體阻滯劑或質子泵抑制劑，基礎治療最常用的藥物有法莫替丁或奧美拉唑、雷貝拉唑、奧美拉唑。
胃粘膜保護劑包括片劑和混懸劑。片劑有Membranostat，包括達喜，混懸劑是鋁鎂加這些藥物，對保護胃黏膜也有很好的作用。
腹痛、腹脹或胃脘痞滿的患者，可積極應用嗎丁啉、穩膜達、瑞奇治療，之後患者需行內鏡治療。如果發現患者在慢性萎縮性胃炎的基礎上有高級別上皮內瘤變，應建議進行內鏡黏膜切除術，這是壹種特殊的胃炎，需要警惕。