1，輸液療法:及時輸液糾正水電解質失衡；貧血嚴重者可輸血，低蛋白血癥者應補充白蛋白；如果脫水或嘔吐嚴重，可以靜脈註射生理鹽水或葡萄糖。
2.鎮痛止瀉藥物:止瀉可用蒙脫石散、復方去氧腎上腺素，腹痛較重者可選用阿托品、山莨菪堿等解痙藥物。
3.抗生素:如果是細菌感染引起的慢性腸炎，可以使用抗生素進行治療，如頭孢菌素、紅黴素、慶大黴素等。
4.改善腸道環境的藥物:雙歧桿菌三聯活菌制劑、雙歧桿菌活菌制劑、乳酸菌等藥物可用於調節腸道菌群。
5.其他藥物:治療真菌感染的抗真菌藥和治療寄生蟲感染的殺蟲藥物。